- الإدارة العامة للمعمل المركزي لمياه الشرب
- الإدارة العامة للمعمل المركزي للصرف الصحي
- الإدارة العامة للصرف الصناعي
تم تجهيز جميع المعامل الرئيسية والفرعية بأحدث الأجهزة للقيام بجميع التحاليل الكيميائية والفيزيائية والبكتريولوجية والبيولوجية وذلك لمراقبة ومتابعة جودة مياه الشرب بالمحطات والشبكات . تنفيذ برامج تدريبية لطلبة كليات العلوم والخدمة العامة للكيميائيين الأشراف المباشر علي منظومات الكلور بالمحطات الكبري والكومباكت بالتعاون مع قطاع التشغيل والصيانه. تم عمل لائحة لتطهير الخزانات الخاصة بالمنشأت الخاصة والعامة وتم العمل بها
تم تزويد جميع المعامل بأجهزة حديثة لمتابعة جودة السيب النهائي بالمحطات تم تجهيز معامل 3 محطات ( فايد – ابوخليفة – القنطرة غرب ) بأعمال مدني وتوريد أجهزة حديثة . تدريب الكيميائيين علي اعمال تشغيل الصرف الصحي وأخذ العينات وتحليلها حسب الطرق القياسية والمبسطة وعمل SOP تم تجهيز معمل سرابيوم ليكون المعمل المركزي للصرف الصحي والصناعي بالشركة
تقوم الإدارة العامة للتحكم فى الصرف الصناعى والادارات التابعة لها بأعمال الرقابة الدورية ومتابعة صرف المخلفات السائلة الصناعية للمنشآت الصناعية والسياحية والصحية والتجارية و العامة من خلال المعاينات وسحب العينات وتحليلها وذلك لضمان مطابقتها لمعايير القانون 93 لسنة 1962م ولائحته التنفيذية المعدلة بقرار السيد / وزير الإسكان رقم 44 لسنة 2000م للحفاظ على البنية التحتية للشركة من شبكات ومحطات الرفع و المعالجة والبيئة المائية المحيطة بنطاق الشركة وإخطار ومتابعة المخالف حتى يوفق وضعه وايضا تعظيم مصادر الدخل المالى للشركة من المعاينات وسحب العينات وتحليلها والحمل الهيدروليكى وأعباء التنقية